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染色質(zhì)免疫沉淀技術(shù)(Chromatin Immunoprecipitation,簡(jiǎn)稱ChIP)——ChIP-IT? Express 染色質(zhì)免疫共沉淀試劑盒

染色質(zhì)免疫沉淀技術(shù)(Chromatin Immunoprecipitation,簡(jiǎn)稱ChIP——ChIP-IT? Express 染色質(zhì)免疫共沉淀試劑盒

       染色質(zhì)免疫沉淀技術(shù)(Chromatin Immunoprecipitation,簡(jiǎn)稱ChIP)是研究體內(nèi)蛋白質(zhì)與DNA相互作用的一種技術(shù)。其原理是:在生理狀態(tài)下用甲醛把細(xì)胞內(nèi)的DNA與蛋白質(zhì)交聯(lián)在一起,通過(guò)超聲或酶處理將染色質(zhì)切為均一的小片段后,利用抗原抗體的特異性識(shí)別反應(yīng),使用DNA結(jié)合蛋白特異性的抗體將目的蛋白和DNA復(fù)合物沉淀下來(lái)。復(fù)合物經(jīng)過(guò)洗滌,解交聯(lián),蛋白酶K消化去除DNA結(jié)合蛋白,經(jīng)純化得到感興趣的DNA片段。純化的DNA片段可用于后續(xù)的分析,比如qPCR,測(cè)序,ChIP-chip,ChIP re ChIP等。

       Active motif公司的ChIP-IT? Express試劑盒使用protein G包被的磁珠,代替?zhèn)鹘y(tǒng)的瓊脂糖珠,使得ChIP實(shí)驗(yàn)可以在1天之內(nèi)完成。試劑盒可以使用超聲法或酶切法進(jìn)行染色質(zhì)的斷裂處理。每種方法都提供快速、可重復(fù)的操作步驟,省時(shí)省力,實(shí)驗(yàn)者更容易獲得成功的ChIP結(jié)果。

1 ChIP-IT? Express試劑盒的操作流程


ChIP-IT? Express試劑盒的優(yōu)點(diǎn)

● 組分完整——提供ChIP實(shí)驗(yàn)所需的所有試劑;

● 可用于檢測(cè)蛋白/DNA的相互作用,不僅僅限于組蛋白的修飾;

● 與全基因組分析或PCR相關(guān)的方法兼容;

● 無(wú)需進(jìn)行試劑和操作步驟的優(yōu)化;

● 無(wú)需酚/氯仿抽提步驟——試劑盒包含DNA純化柱,可對(duì)DNA進(jìn)行快速純化

傳統(tǒng)的ChIP實(shí)驗(yàn)都是使用染色質(zhì)組成相關(guān)的抗體,如乙?;M蛋白抗體。然而對(duì)于啟動(dòng)子轉(zhuǎn)錄活性分析而言,這無(wú)法揭示出是哪種轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合到我們感興趣的啟動(dòng)子上。相比之下,使用轉(zhuǎn)錄因子特異性抗體,能夠直接監(jiān)測(cè)轉(zhuǎn)錄因子和DNA的相互作用,但是這種技術(shù)與傳統(tǒng)的ChIP相比具有更大的挑戰(zhàn),需要準(zhǔn)備多種復(fù)雜的緩沖液,抑制劑混合物和封閉試劑等。而且在缺少抗體、對(duì)照和驗(yàn)證的實(shí)驗(yàn)流程下,很難對(duì)ChIP結(jié)果進(jìn)行驗(yàn)證。為了解決這些問(wèn)題,使得ChIP實(shí)驗(yàn)同時(shí)適用于轉(zhuǎn)錄因子和組蛋白,Active motif公司的ChIP-IT? Express試劑盒提供ChIP實(shí)驗(yàn)所需的所有試劑,包括陽(yáng)性對(duì)照和陰性對(duì)照,使得研究者更容易成功的操作ChIP。

圖2: 改良的ChIP(使用ChIP-IT Express試劑盒)

PCR分析ChIP后的DNA。典型的ChIP實(shí)驗(yàn)每次需要2000,000個(gè)細(xì)胞,使用ChIP-IT Express試劑盒,僅需要100,000或更少的細(xì)胞既可獲得陽(yáng)性的ChIP結(jié)果。

1%的甲醛固定Hela細(xì)胞10分鐘,使用超聲法破碎染色質(zhì),使用陰性對(duì)照IgGRNA pol II抗體,對(duì)不同細(xì)胞數(shù)量來(lái)源(100,000750,000個(gè)細(xì)胞)的染色質(zhì)進(jìn)行ChIP,重復(fù)2次。使用陽(yáng)性對(duì)照引物GAPDH對(duì)ChIP后的DNA進(jìn)行36個(gè)循環(huán)的PCR分析(抗體和引物包含在人ChIP-IT對(duì)照試劑盒里,Active motif也可以提供小鼠和大鼠對(duì)照試劑盒)。取10ul PCR產(chǎn)物進(jìn)行1%凝膠電泳,EB染色后紫外觀察。結(jié)果顯示與使用陰性對(duì)照IgG相比,使用RNA pol II抗體的ChIP大量富集了GAPDH啟動(dòng)子區(qū)域的DNA序列。

相關(guān)產(chǎn)品信息

 供貨商

 產(chǎn)品編號(hào)

 產(chǎn)品名稱 

 規(guī)格

 Active Motif

 53008

 ChIP-IT? Express

 25 rxns

 Active Motif

 53009

 ChIP-IT? Express Enzymatic

 25 rxns

除此之外,Active motif公司還提供特殊應(yīng)用的ChIP試劑盒以及多種ChIP相關(guān)的的輔產(chǎn)品。


供貨商

 產(chǎn)品編號(hào)

 產(chǎn)品名稱

 規(guī)格

 產(chǎn)品說(shuō)明

 Active Motif

 53014

 ChIP-IT? Protein G Magnetic Beads

 25 rxns

 Protein G包被的磁珠

 Active Motif

 53016

 Re-ChIP-IT?

 25 rxns

 雙重ChIP

 Active Motif

 53018

 ChIP-IT? Express HT

 96 rxns

 高通量ChIP,一次可同時(shí)使用96分樣本

 Active Motif

 53019

 Ready-to-ChIP Hep G2 Chromatin

 10 rxns

 即用型的ChIP實(shí)驗(yàn)用染色質(zhì)

 Active Motif

 53020

 Ready-to-ChIP K-562 Chromatin

 10 rxns

 Active Motif

 53021

 Ready-to-ChIP NIH/3T3 Chromatin

 10 rxns

 Active Motif

 53015

Ready-to-ChIP HeLa Chromatin

 10 rxns

 Active Motif

 53026

 ChIP-IT? Control qPCR Kit – Human

 5 rxns

 ChIP對(duì)照試劑盒,包含陰性對(duì)照IgG和陽(yáng)性對(duì)照

 RNA pol II抗體和PCR引物

 Active Motif

 53027

 ChIP-IT? Control qPCR Kit – Mouse

 5 rxns

 Active Motif

 53028

 ChIP-IT? Control qPCR Kit – Rat

 5 rxns

 Active Motif

 53010

 ChIP-IT? Control Kit – Human

 5 rxns

 Active Motif

 53011

 ChIP-IT? Control Kit – Mouse

 5 rxns

 Active Motif

 53012

 ChIP-IT? Control Kit – Rat

 5 rxns

 Active Motif

 53032

 ChIP-IT? Express Shearing Kit

 10 rxns

 超聲法染色質(zhì)處理試劑盒

 Active Motif

 53035

 ChIP-IT? Express Enzymatic Shearing Kit

 10 rxns

 酶切法染色質(zhì)處理試劑盒

 Active Motif

 53040

 ChIP-IT? High Sensitivity

 16 rxns

 高靈敏ChIP試劑盒,適用于低豐度轉(zhuǎn)錄因子、

 低親和力抗體或有限的樣本

 Active Motif

 53041

 ChIP-IT? ChIP-Seq

 10 libraries

 ChIP-Seq劑盒

 Active Motif

 53045

 ChIP-IT? FFPE

 16 rxns

 適用于福爾馬林固定,石蠟包埋組織樣本的ChIP

 Active Motif

 53042

 ChIP-IT? PBMC

 16 rxns

 適用于外周血單核細(xì)胞的ChIP

 Active Motif

 53024

 RNA ChIP-IT?

 25 rxns

 用于研究RNA與細(xì)胞核染色質(zhì)的相互作用

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